??專注R語言在??生物醫(yī)學(xué)中的使用 設(shè)為“星標(biāo)”,精彩不錯(cuò)過 前面我們已經(jīng)講過邏輯回歸模型的校準(zhǔn)曲線的畫法,這次我們學(xué)習(xí)cox回歸的校準(zhǔn)曲線畫法。 準(zhǔn)備數(shù)據(jù) 使用自帶數(shù)據(jù)lung數(shù)據(jù)集進(jìn)行演示。 這個(gè)是關(guān)于肺癌的生存數(shù)據(jù),一共有228行,10列,其中time是生存時(shí)間,單位是天,status是生存狀態(tài),1是刪失,2是死亡。其余變量是自變量,意義如下: inst:機(jī)構(gòu)代碼,對(duì)于我們這次建模沒啥用age:年齡sex:1是男性,2是女性ph.ecog:ECOG評(píng)分。0=無癥狀,1=有癥狀但完全可以走動(dòng)
大家好,我是鄧飛,今天介紹一下TwoSampleMR包如何設(shè)置token,從而可以使用數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)進(jìn)行孟德爾隨機(jī)化的分析。 1,安裝TwoSampleMR包 這個(gè)包在github上面,之前流行用devtools包安裝github上的R包,但是devtools本身就特別難安裝,好在現(xiàn)在有了 remotes包,這個(gè)包比較好安裝,進(jìn)而github上面的包也比較好安裝了。 # install.packages("remotes")library(remotes)install_github("MRCI
莊閑和游戲 電腦必裝的四款神仙軟件,趕快卸載那些沒用的流氓軟件吧
2026-01-14俗話說得好,手巧不如家什妙! 這句話的意思是人的手再靈 巧,也不如有好的工具。手藝再好,也得靠趁手或先進(jìn)的工具幫忙。 第一款FastStone Capture {jz:field.toptypename/} 圖片 FastStone Capture是一款體積小巧卻功能強(qiáng)大、簡單易用的屏幕捕捉工具。 它集屏幕截圖、圖像編輯與視頻錄制等功能于一身。能夠捕捉屏幕上的任意區(qū)域,提供多種捕獲方式,如活動(dòng)窗口、指定窗口/對(duì)象、矩形區(qū)域、手繪區(qū)域、整個(gè)屏幕、滾動(dòng)窗口等。此外,還附帶屏幕錄像機(jī)、放大鏡、取色器
圖片 前言 Hello小伙伴們大家好,我是生信技能樹的小學(xué)徒”我才不吃蛋黃“。今天是肺腺癌單細(xì)胞數(shù)據(jù)集GSE189357復(fù)現(xiàn)系列第三期。第二期我們對(duì)細(xì)胞亞群進(jìn)行了注釋(肺腺癌單細(xì)胞數(shù)據(jù)集GSE189357復(fù)現(xiàn)(二):細(xì)胞注釋)。 本期,我們將使用多種可視化方法,繪制FeaturePlot,ggplot,DoHeatmap圖。 1.背景介紹 在胃癌系列推文中,我提到繪好看圖需要審美能力強(qiáng)。實(shí)際上,繪圖能力也能很好的反映我們的科研素養(yǎng)。繪圖能力與科研能力之間的關(guān)系非常緊密,因?yàn)橛行У目梢暬诳茖W(xué)研
莊閑和游戲 使用小提琴圖可視化目的基因并計(jì)算顯著性
2026-01-14前情回顧 在這個(gè)月的前幾期推文中,主要基于單細(xì)胞數(shù)據(jù)使用小提琴圖可視化marker基因進(jìn)行了整理: VlnPlot結(jié)果及常用參數(shù)淺析 基于VlnPlot參數(shù)及ggplot2美化小提琴圖 也有一期答讀者問——小提琴圖有點(diǎn)無圖是何緣由? 這期就一起來學(xué)習(xí)一下畫目的基因的小提琴圖并計(jì)算顯著性! 小提琴圖可視化并計(jì)算顯著性用途 在單細(xì)胞數(shù)據(jù)分析中,通過小提琴圖可視化和顯著性計(jì)算可以幫助研究者直觀且統(tǒng)計(jì)地評(píng)估目的基因在不同細(xì)胞群體中的表達(dá)差異 展示基因在不同細(xì)胞群體的表達(dá)分布:小提琴圖可以直觀地展示基因
莊閑和游戲 新版白話空間統(tǒng)計(jì)(44)空間聚類:局部莫蘭指數(shù)(Anselin Local Moran''s I)簡介與參數(shù)說明
2026-01-14好了,寫了好幾篇的聚類,有同學(xué)都在問蝦神,說沒想到你這個(gè)濃眉大眼的家伙也當(dāng)叛徒了,背叛了空間統(tǒng)計(jì)學(xué)隊(duì)伍……好吧,還是那句話,空間統(tǒng)計(jì)學(xué)是蝦神的看家本領(lǐng),所以那是肯定不能丟掉的。 當(dāng)然,今天我們要講的還是聚類,不過是妥妥的空間聚類。 話說,前面一直都在強(qiáng)調(diào),空間分布模式主要就是三種: {jz:field.toptypename/} 圖片 而全局的莫蘭指數(shù)可以通過計(jì)算公式,來表明整個(gè)研究空間中的樣本數(shù)據(jù)所表達(dá)出來的總體特征,但是這個(gè)總體特征是所有模型加權(quán)出來的結(jié)果,自然就會(huì)掩蓋掉里面的很多細(xì)節(jié)。
莊閑和游戲 R包推薦Liana:受配體分析框架-多種分析方法整合
2026-01-14建站客服QQ:88888888 作者建議:We recommend all users to consider using [LIANA+](https://liana-py.readthedocs.io/en/latest/index.html), instead of LIANA, due to it's increased efficiency and completeness. We plan to eventually port all LIANA+ functionalit
莊閑和游戲 如何隱藏和保護(hù)上網(wǎng)隱私與瀏覽器記錄?
2026-01-14發(fā)現(xiàn)現(xiàn)在大家都開始重視起了個(gè)人上網(wǎng)隱私問題!很好!畢竟,誰都不希望自己的上網(wǎng)蹤跡被肆意窺探,個(gè)人數(shù)據(jù)無端泄露。下面整理了一些實(shí)用的保護(hù)網(wǎng)隱私與數(shù)據(jù)安全方法,以下這些實(shí)用建議值得參考: 圖片 1. 啟用隱私模式瀏覽網(wǎng)頁 幾乎所有主流瀏覽器,像是Chrome、Firefox、Safari 等,均貼心地設(shè)有隱私或無痕模式。開啟該模式后瀏覽網(wǎng)頁,瀏覽器便不會(huì)留存您的歷史記錄、Cookie 以及網(wǎng)站數(shù)據(jù)。換言之,待您關(guān)閉瀏覽器窗口的瞬間,那些瀏覽痕跡統(tǒng)統(tǒng)會(huì)被一鍵刪除,旁人自然沒機(jī)會(huì)查看您的上網(wǎng)軌跡。 不
莊閑和游戲 241,DeepSeek 新手入門使用教程(2025最新版)
2026-01-14一、快速訪問與賬號(hào)注冊(cè) 1.網(wǎng)頁版入口瀏覽器訪問DeepSeek官網(wǎng)(deepseek.com) ,點(diǎn)擊「開始對(duì)話」按鈕即可使用基礎(chǔ)功能。國內(nèi)用戶無需VPN,加載慢時(shí)可配合迅游加速器優(yōu)化網(wǎng)絡(luò)。 {jz:field.toptypename/} 2.手機(jī)端使用 應(yīng)用商店搜索「DeepSeek」下載APP(支持iOS/安卓)。微信用戶可直接通過小程序使用。 3.注冊(cè)與登錄 新用戶需手機(jī)號(hào)/郵箱注冊(cè),接收驗(yàn)證碼完成驗(yàn)證。支持微信一鍵登錄(推薦手機(jī)端)。二、基礎(chǔ)功能使用指南 1.智能問答在輸入框直接提問
莊閑和游戲 236,普通人也能輕松上手!DeepSeek 使用指南
2026-01-14你是否曾經(jīng)遇到過這些問題: - 想快速了解某個(gè)知識(shí)點(diǎn),但不知道從哪里開始? - 需要處理一份文件,但覺得太復(fù)雜無從下手? - 想寫一篇文章或郵件,卻不知道如何組織語言? 別擔(dān)心,DeepSeek 就是為你準(zhǔn)備的!它是一款智能助手,可以幫助你解決這些問題。即使你完全不懂技術(shù),也能輕松上手。下面,我將從普通人的角度,帶你一步步了解如何使用 DeepSeek。 圖片 1. 什么是 DeepSeek? DeepSeek 是一款基于人工智能的工具,你可以把它想象成一個(gè)“萬能助手”。它能回答你的問題、幫你
















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